Chaque partenaire du projet est amené à participer à un ou plusieurs groupes de travail au sein du projet OCEANOMICS, en fonction des compétences qui lui sont propres.
Cette thématique regroupe trois groupes de travail visant à assembler les métadonnées environnementales, les données d’imagerie cellulaire et les données de séquençage. Le premier groupe de travail (Données environnementales) s’attèle à traiter les paramètres physico-chimiques et bio-optiques collectés lors de chaque station de l’expédition Tara-Océans. Le second groupe de travail (Données morphologiques) vise à générer et analyser des images des organismes de toutes les fractions de taille collectées. Enfin, le troisième groupe (Données génétiques) traite des données de séquençage qui concernent ces échantillons et les génomes de référence générés à partir d’espèces isolées ou de communautés symbiotiques d’intérêt.
Deux groupes de travail sont intégrés à cette thématique. Un des aspects majeurs du projet concerne l’archivage de tous les types de données générées au cours de l’expédition Tara-Océans et au sein du projet OCEANOMICS. Le premier groupe (Archivage de données) vise à développer un portail présentant un système de recherche qui permettra à l’utilisateur de localiser tous les types de données disponibles et les analyses qui en découlent. En étroite relation avec ce portail, un groupe de travail (Bioinformatique et modélisation des écosystèmes) s’applique à développer des outils bioinformatiques visant à analyser les données générées et à comprendre les écosystèmes planctoniques de manière holistique.
Une partie des tâches d’OCEANOMICS est dédiée à la recherche appliquée (Criblage et Recherche de composés actifs) et étudie le potentiel des organismes planctoniques à donner lieu à de nouvelles utilisations innovantes de ces écosystèmes en industrie. En parallèle, un groupe de travail est dédié au rayonnement du projet (Innovation, valorisation et communication) auprès de divers publics : industriels, financeurs, enseignants, grand public.
De manière transversale, un groupe de juristes étudie les questions légales et éthiques liées à l’étude de bioressources marines prélevées en différents points du globe terrestre.